选择适合自己的服务器系统需要综合考虑多个因素，以下是一些关键要点：

一、业务需求

应用程序类型

1.如果您的应用程序是基于Microsoft.NET框架开发的，如许多企业内部使用的业务流程管理软件，Windows Server 可能是较好的选择。因为它能与.NET 应用程序无缝集成，并且 IIS（Internet Information Services）可以很好地部署和运行这些 Web 应用程序。

2.对于以 LAMP（Linux、Apache、MySQL、PHP）或 LEMP（Linux、Nginx、MySQL、PHP）架构构建的网站或 Web 应用程序，Linux 服务器系统（如 Ubuntu Server、CentOS 等）则更为合适。这些架构在 Linux 系统上经过了广泛的验证，能够高效地提供 Web 服务。例如，WordPress 网站在 Linux + Apache/ Nginx + MySQL 的环境下运行良好，并且有丰富的开源工具和插件支持。

3.如果是运行一些高性能计算任务，如科学计算、大数据分析等，Unix 系统或者特定的 Linux 发行版（如针对高性能计算优化的版本）可能更合适。因为它们在处理大规模数据和复杂计算方面有更好的性能表现。

服务功能需求

1.对于需要提供文件共享和打印服务的企业内部网络，Windows Server 的图形化管理界面使得设置文件服务器和打印服务器相对简单。其活动目录（Active Directory）服务也便于管理用户对文件和打印机的访问权限。

2.如果您主要是搭建 Web 服务器、邮件服务器或数据库服务器，Linux 系统有多种成熟的开源软件可供选择。例如，对于 Web 服务器可以使用 Nginx 或 Apache；对于邮件服务器可以使用 Postfix 或 Sendmail；对于数据库服务器可以使用 MySQL 或 PostgreSQL。这些软件在 Linux 系统上的性能和稳定性都得到了广泛认可。

二、技术能力和维护成本

1.技术团队的技能水平

1.如果您的技术团队对 Windows 操作系统比较熟悉，那么 Windows Server 可能更容易维护。因为它的管理工具和操作方式与 Windows 桌面系统有很多相似之处，团队成员可以较快地掌握服务器的配置和管理，如使用服务器管理器进行角色和功能的添加和配置。

2.而对于熟悉 Unix/Linux 命令行操作的团队，Linux 或 Unix 服务器系统可能是更好的选择。他们可以利用命令行工具高效地进行系统配置、软件安装和故障排除。例如，在 Linux 系统中，通过命令行可以快速安装和配置如 Nginx 等软件，使用诸如 “apt - get”（Debian/Ubuntu）或 “yum”（CentOS）等包管理工具。

2.维护成本考虑

1.Windows Server 通常需要购买软件许可证，这会增加一定的成本。不过，它也提供了相对容易获取的技术支持，例如通过 Microsoft 官方的支持渠道。

2.Linux 系统大多是开源免费的，能为企业节省软件购买成本。但是，可能需要投入更多的时间来学习和维护，因为其更新和补丁管理可能不像 Windows Server 那样集中。不过，Linux 社区提供了丰富的文档和技术支持资源，技术人员可以通过社区获取帮助。

3.Unix 系统一般用于高端企业级应用，软件许可证和硬件设备通常比较昂贵。并且，Unix 系统的技术支持相对复杂，往往需要专业的技术人员或者与系统供应商签订维护协议。

三、安全性和稳定性要求

1.安全性需求

1.Windows Server 有自己的安全机制，如通过活动目录进行用户身份验证和权限管理，并且会定期发布安全更新。然而，由于其在桌面市场的广泛使用，也更容易成为黑客攻击的目标。

2.Linux 系统的安全特性主要体现在精细的文件权限控制和开源社区的快速安全响应上。例如，通过合理设置文件的所有者、所属组和权限，可以有效地防止非法访问。并且当安全漏洞出现时，社区会迅速发布补丁。

3.Unix 系统以高安全性著称，特别是在金融和电信等对安全要求极高的行业。其安全机制经过了多年的验证和完善，能够有效抵御各种安全威胁，如在银行的核心交易系统中保障交易数据的安全。

2.稳定性要求

1.Unix 系统和一些经过长期验证的 Linux 发行版（如 CentOS）在稳定性方面表现出色，能够长时间不间断运行。它们适用于对系统停机时间要求极低的应用场景，如电信运营系统和金融交易系统。

2.Windows Server 也具有较高的稳定性，但在某些复杂的网络环境或高负载情况下，可能需要更多的优化和维护工作来确保系统的稳定运行。